حتى أصغر الكائنات الحية يمكن أن يكون لها تأثير كبير في الصحة.
مصر:إيهاب محمد زايد
في مؤتمر الميكروبات التابع للجمعية الأمريكية لعلم الأحياء الدقيقة (ASM) 2024، اجتمع العلماء والباحثون ومتخصصو الرعاية الصحية لاستكشاف كيف تعمل أحدث الأبحاث الميكروبية على تشكيل مستقبل البشرية.
من علم البيئة والعلوم البيئية إلى الأبحاث السريرية والصحة العامة، تابع القراءة لتعرف مدى دقة قراءات المسام النانوية بأي طول والتي تتيح اكتشافات رائدة في عالم الميكروبات.
تجميع الجينومات البكتيرية كاملة ودقيقة للغاية
وكان من أبرز الأحداث عرض رايان ويك (جامعة ملبورن، أستراليا) حول أدوات واستراتيجيات تجميع الجينوم المعزول للبكتيريا، مما يدل على أحدث دقة أساسية لتسلسل المسام النانوية والتحول التدريجي من التجميعات متعددة المنصات إلى استخدام تسلسل المسام النانوية وحده.
لقد قدم مجموعة من كليبسيلا كانت دقيقة بنسبة 99.99995% (Q63.0) مع بيانات المسام النانوية فقط – دون الحاجة إلى قراءات قصيرة! يعد هذا إنجازًا مذهلاً، ويفتح الباب أمام التجميعات التي تحتوي على ثقوب نانوية فقط، لتصبح الممارسة القياسية لأبحاث علم الأحياء الدقيقة.
في للجمعية الأمريكية لعلم الأحياء الدقيقة، تم رؤية تأثير تسلسل المسام النانوية بما يتجاوز الدراسات البكتيرية. كورينا ل. تابرون وآخرون. (American Type Culture Collection، الولايات المتحدة) بحثت فيما إذا كان تسلسل المسام النانوية يمكن أن يحسن جودة مجموعات الجينوم الفيروسي مقارنة بالتسلسل قصير القراءة.
تم العثور على تسلسل ثقب النانو لتحسين متوسط طول التجميع واكتمال الجينوم بشكل كبير، وتقليل أعداد contig بشكل كبير.
في مجال علم الميتاجينوم، وجدت آنا كوسكو (جامعة فودان، الصين) أن تسلسل المسام النانوية فقط كان مناسبًا لبناء جينومات مجمعة ميتاجينومًا شديدة التقارب (MAGs)، حيث أن 43% من MAGs عبارة عن تجميعات مفردة عالية الجودة.
قدرة أكبر على تحديد الأنواع
بالإضافة إلى تقديم صورة كاملة عن علم الوراثة للكائن الحي، كان الباحثون يشاركون أيضًا كيفية استخدام تسلسل المسام النانوية لتقديم رؤى شاملة حول الميكروبيوم.
تايلور E. جين وآخرون. (جامعة ولاية كارولينا الشمالية، الولايات المتحدة) شاركت كيف اكتشف تسلسل المسام النانوية عددًا أكبر بكثير من الأصناف على مستوى الأنواع مقارنةً بأساليب القراءة القصيرة عند استخدام النهج المستهدف 16S.
وقد وفر هذا فهمًا أكثر شمولاً للميكروبات الحيوية للبراغيث، مما ساعد على تشخيص وعلاج الحيوانات الأليفة المصابة.
ومع العلم بأن تسلسل ثقب النانو يوفر صورة كاملة ودقيقة، فإن الباحثين واثقون من استخدام هذه الأجهزة في الميدان. ناقشت كياكين بيان (معهد جورجيا للتكنولوجيا، الولايات المتحدة) سير عملها في مجال المسام النانوية لتحديد وقياس الكائنات الحية الدقيقة في الموقع.
مع نتائج مماثلة لتلك التي تم إنتاجها باستخدام تسلسل القراءة القصيرة، تظهر فوائد قابلية النقل في المقدمة.
يوجد على خشبة المسرح رجل على اليسار، يقف خلف المنصة وينظر إلى المتحدثين الأربعة الجالسين على يمينهم. أحد المتحدثين لديه ميكروفون والآخرون يستمعون إلى حديثها.
تتيح إمكانية النقل للباحثين تنفيذ برامج مراقبة الأمراض المعدية بشكل فعال والاستجابة في سيناريو تفشي المرض. ناقش ماثيو كيلر (مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها، الولايات المتحدة) وجوش كويك (جامعة برمنغهام، المملكة المتحدة) عملهما، وعرضا كيفية استخدامهما لتسلسل المسام النانوية للمساعدة في تحسين صحة الإنسان.
